Enam bulan setelah Tn. Hopp mengambil semuanya dari Ruby kecil selama acara Rumah Bermain Tn. Hopp, dia kembali lagi.

Setelah pertemuan yang dekat, Ruby akhirnya terjebak di Dunia Bawah, sebuah dunia di mana jiwa-jiwa yang hilang berkeliaran selamanya melalui kegelapan. Dia bertemu dengan gadis manusia lain bernama Esther dan bersama-sama mereka harus memecahkan teka-teki, menghindari jebakan, dan mengatasi musuh jahat untuk menemukan Enam Medali dan mengakhiri pemerintahan Entitas, untuk selamanya.

Lari dan sembunyi dari mainan yang berubah menjadi monster; Tn. Hopp, kelinci yang suka memelihara rambut, Tn. Stripes, harimau yang menakutkan, dan Nona Bo, panda yang membuat panik. Lawan bos raksasa yang menjulang di atasmu, bantu Ruby menemukan orang tuanya yang hilang dan mengungkap masa lalu Esther yang meresahkan.

Mr. Hopp's Playhouse 3 adalah game petualangan dengan elemen pertempuran ringan dan berbagai teka-teki untuk dipecahkan agar bisa maju, menampilkan gaya grafis yang terinspirasi oleh era awal game 3D di PS1 dan N64.